對於倭國，朱載坖一直是十分之警惕的，這些年也有不少重臣向朱載坖上疏說明倭國狼子野心，久必為患，對於這點朱載坖也是很清楚的，現在倭國之所以相對平靜，是因為現在大明還在倭國屯駐了重兵，但是現在倭國朝廷顯然已經有些不安分，這點是朱載坖很擔心的，這說明大明應該開始調整對倭國的政策了。

朱載坖為此召見了內閣輔臣和相關的部院重臣，還有練兵軍務處的參贊軍務大臣們的，一道商量應該怎麼應對倭國的事情，朱載坖將方逢時和劉綎的奏疏給諸位部院重臣們看了之後詢問道：“諸位怎麼看此事，倭人又有些不安分了。”

對於此事，王錫爵還是有些發言權的，王錫爵畢竟擔任過安東都護，對於倭國的情況還是有些瞭解的，同樣的還有徐渭等人，他們對於倭國的情況也還是知道一些的，他們認為確實是應該改變對於倭國的一些政策了，對於大明而言，之前由於倭國地方勢力過於強大，容易影響大明在倭國的利益，所以大明在倭國所採取的是強幹弱枝的辦法，即對於倭國的地方勢力採取加以抑制的態度，同時對於倭國朝廷採取扶持的政策，這是是根據當時倭國的實際情況所作出的決策。

就當時的情況而言，大明的這個辦法顯然是是有很好的效果的，因為對於當時的倭國來說，所謂的倭國朝廷已經根本沒有什麼威信可言了，倭國國王比之漢獻帝都不如，各個地方勢力雄踞一方，而大明不可能在倭國投入重兵，一個一個的予以討平，所以對於當時的情況，採取強幹弱枝是正確的。

但是到了現在，倭國的情況已經是朝廷必須要予以調整政策了，隨著倭國朝廷勢力的增強，他們試圖反抗大明，這是絕對不能允許的，現在倭國是大明重要的資源產地和商品市場，對於大明來說，倭國的地位是十分之重要的，不僅僅是金銀、硫磺還有銅料等重要的戰略物資，還有未來倭國在交通上的重要地位，這些都是非常之重要的，所以務必要採取有力的措施。

而練兵軍務處的參贊軍務大臣們意見是很簡單的，既然倭國朝廷不聽話，就應該換一個，甚至乾脆將倭國加以郡縣，不過朱載坖認為現在對於倭國實施郡縣的時機還不成熟，畢竟倭國是一個長期游離於大明朝貢體系之外的國家，並且倭國從來就不是大明的領土，吃掉一個藩屬，對於大明的宗藩體系是極大的衝擊，之前大明對於安南等地用兵，尚且可以用收復故土作為理由，但是其實已經在大明的這些藩屬中震撼頗大了，這點朱載坖是很清楚的，現在對於大明來說，是要穩定宗藩體系，以宗藩體系加強大明對於這些藩屬的經濟和政治控制，所以此時將倭國加以郡縣其實是不太合適的。

這點朱載坖是很清楚的，但是對於倭國現在的情況，大明也絕對不能坐視，在和重臣們商量之後，朱載坖決定加強在倭國的軍事存在，這點是很重要的，安東都護府實力最強大的時候，麾下官軍達到過十萬之眾，對於倭國形成了強大的震懾能力，後來因為倭國的形勢逐漸穩定下來，同時大明又在安南等地用兵，所以大明朝廷持續的將安東都護府的官軍調走，現在整個安東鎮下轄官軍僅有三萬餘，再加上安東五衛和安東五屯衛的衛所官軍，可以之兵也不超過五萬，而且各個衛所分散在各地，削弱了朝廷對於倭國的控制。

朱載坖決定從親軍諸衛中抽點兩衛，輪換駐防安東都護府，增加安東都護府的實力，除了這些脫產士卒之外，也要繼續增加在倭國的衛所官軍，朱載坖命令再組建鎮東五衛，駐守在倭國的戰略要地，同時提高安東都護府下設個衛所脫產軍士的比例，各衛所脫產和屯田軍士五五開，屯衛也要保留三成的脫產士卒，以應對可能出現的問題。

同時就是調整大明對於倭國的政策，之前大明為了統治倭國比較方便，所以一直採取的是加強倭國朝廷的權威，利用倭國朝廷來推行大明的相關政策，顯然看來，倭國朝廷顯然已經不太明白自己有幾斤幾兩了，必須加以敲打，朱載坖命令安東都護府也要扶持一些對大明恭順的地方勢力，以平衡倭國內外的局勢。

對於倭國朝廷，大明也要採取相應的措施，首先就是直接削弱其兵力，之前朱載坖一直在調動倭軍前往安南一事上有所猶豫，現在朱載坖決定從倭國朝廷中調走部分倭軍，前往安南，協助官軍剿除安南的反抗勢力，同時密諭提督安南軍務吳惟忠，將這批倭軍儘可能的留在安南，同時削減倭軍的總員額，倭國朝廷軍隊和各地方勢力的軍隊、巡檢等力量，必須低於官軍員額的七成，同時繼續收繳倭國民間武器，削弱倭國的軍事力量。

朱載坖還派遣錦衣親軍赴倭國，詳細偵查倭國朝廷內部對大明不滿的人，即便是倭王，敢於對大明不滿，朱載坖也要讓他體面的，同時加強同化，頒佈命令，廢除倭國的各種假名，全面使用漢字和漢語，加強對於倭國的同化，之前雖然倭國的各種文書皆以漢字寫成。但由於漢文經典的文言文極為難解，漢字筆畫又多，對當時的倭國人來說，非常難學，便間接造成只限一小部分耐得住十載寒窗的書生，或有錢有勢、能僱家庭教師讓子女進修的貴族階層，得以識字書寫外，其餘大部分民眾均是漢文文盲的結果。

所以才會出現所謂的假名，朱載坖命令廢除倭國的假名和語言，在倭國推行漢化，即使用漢字，說漢語，以洪武正韻為基礎，將其民族特點逐漸予以消磨，為日後的郡縣創造條件。