朱載坖很久沒有出現在朝堂上了，但是朱載坖用自己的行動表明了，朱載坖雖然將日常事務的處理交給了太子，但是一直在沉默的注視著整個朝廷，一旦朱載坖要出手的話，依舊是絕對不留情面的，對於這些想要倚仗宗族勢力對抗朝廷的，朱載坖絕對不會輕易放過，膽敢挑釁朝廷的，朱載坖是覺不容忍的。

同時，原閩浙總督自陳不職，朱載坖也直接將其罷官永不敘用，調南京吏部左侍郎王篆加南兵部尚書總督閩浙等處軍務事兼督理糧餉，要求王篆嚴厲懲處敢於抗稅的行為。

而朱載坖則是在西苑召集太子和內閣輔臣、部院重臣，商量工商賦稅的事情，朱載坖首先是要求對於現在工商賦稅徵繳過程中出現了各種弊端予以總結，而針對這些弊端，也要予以處理，閣部重臣們認為，現在從工商賦稅的徵繳實際情況來說，主要的問題還是對於各種賦稅的打擊力度不足，因為現在各地的課稅司局人力不足，同時缺乏監督，稅務分司畢竟是在省城，對於各課稅司局的監督是有限的。

這就給了各課稅司局弄虛作假的可能了，畢竟他們很多也是當地人，在接受賄賂之後睜一隻眼閉一隻眼也是很正常的事情，同時即便是課稅司局或者是稅務分司發現了一些偷稅漏稅的情況，移送地方官府或者是按察使司處理，速度也是很慢的，對於稅務總署，重臣認為確實是需要有一支獨立的查緝力量，來懲治各種的偷稅漏稅行為了。

這點得到了朱載坖的同意，朱載坖決定，在稅務總署下設稽查總局，專門負責偵查偷逃稅款的行為，各省直和重點地方則是要設立稽查局，歸轄區的稅務分司管理，他們專門負責偵辦抗稅、偷稅、漏稅等案件，不僅僅有大量文職的吏員負責查照證據，核算賬目等，同時還有一支精幹高效的武裝力量，用於處置嚴重的抗稅和偷稅漏稅，這樣以來，涉及到稅務的各種案件，由稅務總署的稽查局偵查之後直接移送大理寺分司審斷，無需再有地方官府插手，這樣的話，鞏固中央政權、強化稅收徵管，避免出現抗稅和偷稅漏稅得不到懲治的情況。

同時也要加強對於地方各課稅司局的管理和監督，對於這些課稅司局的賬目也要嚴格稽核，實施更調變度，不光是官員，相關的吏員也要定期輪換，防止日久生弊，稽查局不僅僅要偵辦各種抗稅和偷稅漏稅，也要偵辦稅務部門內部的各種貪腐案件，所需要的各種的人員從國子監算學、明算科中選拔任用，同時從錦衣親軍中調派人員給稽查局，提督稽查總局加錦衣親軍副都指揮使銜，可以利用錦衣親軍的驛傳渠道，直接向朱載坖奏報。

同時在各省直設立轉運使，由各省直稅務分司長官兼任，其職務全稱為某省轉運使兼提督稅務分司，負責通省的非農業賦稅的徵繳和各種物資的解運，同時針對南直、浙江、江西等省，在省轉運使之上還有駐節松江府的東南發運使兼漕運使，負責將東南各省直的賦稅以及朝廷所需要的各種物資，透過海運和漕運轉運到京師來。

朱載坖還命令戶部，制定詳細的賦稅徵收、解運流程，保證朝廷的賦稅如期徵解，在朱載坖的嚴旨之下，朝廷徵收工商賦稅的政策開始得以推行，同時朱載坖透過詔書昭告天下，百姓可以直接到各課稅局、稽查局舉報各種偷稅漏稅的行為，朝廷以查實的百分之五獎勵給百姓，同時對於曾經偷稅漏稅但是主動自首的，可以補繳賦稅之後免予處罰，偷稅漏稅被查獲了，能夠補繳稅款並且罰款之後，也可以免予處罰，但是對於第二次偷稅漏稅，不僅要加重處罰，還有抄沒家產。

這些詔書，不僅透過郵驛系統還透過皇明時報予以傳播，對於朱載坖嚴厲打擊這些行為，朝廷上下認為朱載坖處置的手段過於嚴酷了，但是朱載坖根本不為所動，朱載坖很清楚，能夠被查出來的偷稅漏稅能有多少？以朝廷現在的能力，有很多偷稅漏稅的情況朝廷是無法掌握的，在這種情況之下，為了保證朝廷的賦稅徵繳，朱載坖不得不採取嚴刑峻法。

不過對於朱翊釴這次的處置，朱載坖還是很滿意了，隆慶二十四年是一個相對比較好的年份，從隆慶十八年開始的連續旱災在隆慶二十四年終於有所緩解了，這次乾旱地域廣、變化大，大範圍乾旱持續6年。乾旱事件可分為前後兩段，前段呈北旱南澇的旱澇分佈格局，後段旱澇分佈格局有改變，北方開始多雨，乾旱區擴大並南移至長江流域及江南。由各省逐年受旱成災的縣數量不少，前段受旱最重的是河北、山西，後段受旱最重的是南直隸和湖南，旱災持續最久的則是河南。

雖然有引進的各種作物和朝廷的儲備，但是民變和流民問題一直是懸在大明君臣上的一把利劍，這也是之前為什麼朱載坖對於物價上漲這麼緊張的原因，隆慶二十三年的大旱最厲害的一年，各地河湖井泉乾涸記錄可旁證乾旱程度，例如，南直“淮河竭、井泉涸、野無青草”；浙江“運河龜坼赤地千里，河中無勺水”等。幸好朱載坖在之前大力的加強倉儲，有了常平倉和京通倉以及各地備荒倉的支援，還有從暹羅、占城能地海運而來的糧食，同時朝廷實施大規模的移民政策，將這些受災地區的災民遷移到遼東、大寧、臺灣、河套等地，才勉強度過了。

而在隆慶二十四開春，各受災省份都奏報今年還是風調雨順，能夠正常開展農耕了，正對於朝廷來說無疑是一件好事，因為朝廷的倉儲也已經快要見底了，要是再繼續持續下去的話，朝廷的倉儲一樣支撐不了。