朱載坖作出了決定之後就先讓重臣們回去了，而後朱載坖和太子開始商量此事了，朱載坖問道：“太子以為，此事現在應該怎麼處理啊？”

對於朱載坖的這個問題，太子也在思考，太子說道：“父皇，這次申閣老他們出了大力，然蘇松士紳，亦不可不防啊。”

朱載坖閉著眼睛只是只是點點頭，申時行他們促成此事，只不過是為了借朝廷之手打擊這些閩粵海商罷了，這點朱載坖是很清楚的，在這個目的上，朝廷和東南士紳們的目的是一致的，所以這些申時行等人才會積極配合朝廷，但是在具體打擊到什麼程度這個問題上，朝廷和這些東南士紳們的目的是顯然不同的。

朝廷要的是加強對於閩粵地方的控制，打擊宗族勢力，建立朝廷的威信，同時整頓走私，保證朝廷的賦稅，所以對於閩粵的打擊主要是針對的走私商人和地方宗族勢力，但是東南士紳們顯然是希望朝廷打擊整個閩粵商幫，好為東南的這些商人爭取時間，這不是朱載坖想要的，不能夠讓東南一家獨大，這點一向是朱載坖的政策，所以在這點上，朝廷和東南士紳們顯然不是一個路子。

而在申時行的府上，一眾東南出身的官員都聚集在一起，朱載坖命令為朱紈加以贈諡，同時對於林希元家族加以重懲，這都是東南士紳們所樂見的，他們希望朝廷能夠進一步加大打擊閩粵海商的力量，這樣是東南士紳們所樂見的。

但是申時行可沒有這麼樂觀，他很清楚對於朝廷來說，打擊這些閩粵海商的問題和東南士紳們是完全不同的，這點申時行作為首輔是很清楚的，朱載坖作為皇帝，自然是要打擊閩粵的地方勢力，但是對於東南士紳集團，朱載坖同樣是極為防備的，所以申時行十分之清楚，事情的發展不可能完全按照東南士紳們的想法進行。

要使得自己的利益最大化，必須趁著這個機會在閩粵安排人手，同時在朝廷政策上對於閩粵海商進行儘可能的限制，以保障東南士紳的利益，這兩個問題都是不好解決的，要想在閩粵安排人手，要透過吏部才行，而現在吏部尚書楊俊民是醋黨大佬，文選司郎中方從哲也是太子的人，要向他們透過，恐怕並沒有這麼容易。

在戶部尚書龐尚鵬儘管在這次朝廷收拾閩粵一言不發，但是他畢竟是廣東人，不可能完全坐視此事的，要想透過戶部以及戶部下屬的各個衙門去打擊閩粵商幫，難度也是不小的，這點申時行是很清楚的，所以必須加以籌劃，申時行一面讓小弟們去尋摸合適的人才，還有在輿論上造勢，要求朝廷嚴厲打擊這些閩粵商人，這點是極為重要的，朝廷必須明確這個態度才行。

同時申時行自然也要在內閣之中縱橫捭闔，儘可能的為東南士紳創造條件，而在朱載坖的授意之下，太子也召見了上疏致仕的禮部尚書陳經邦和戶部尚書龐尚鵬兩人，他們都是現在朝廷上閩粵商幫的重要代理人，在朝廷上的地位也是十分之重要的，太子也要召見他們，聽取他們的意見。

太子首先還是對於陳經邦予以安撫，此事和他並沒有什麼直接的關係，朱載坖也不會因此加罪於他的，這點是極為重要的事情，同時就是向他們兩人詢問閩粵之事的解決辦法，對於朝廷來說，雖然是要打擊閩粵集團，但是並不是要將閩粵商幫按死，而是要將他們置之於朝廷的管理之下，這是朝廷的主要目的。

尤其在這次朝廷打擊閩粵勢力當中，戶部尚書龐尚鵬一直沒有發表任何意見，所以這次太子召見他也是想他詢問相關的事項。

太子問道：“此事朝廷為朱紈昭雪，陛下已經下旨贈諡朱紈，大宗伯還是要在此事上多上心。”

陳經邦自從上疏請求致仕之後，就沒有到衙理事了，朱翊釴是透過這種方式催促陳經邦到衙理事，對於朝廷來說，陳經邦作為禮部尚書還是極為重要的，陳經邦業只得領命，朱翊釴接著問道：“大司徒執掌國計，為何對於此事一語不發？”

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