朱載坖要求戚繼光和李成梁在制定作戰計劃的時候料敵從寬，尤其是這次官軍是在幾乎完全陌生的地域作戰，可能會遭遇到各種問題，所以必須要料敵從寬才行。

對於朱載坖的這個要求，各位重臣們也認為是合適的，朱載坖最關心的仍舊是後勤輜重的保障，大軍在千里之外作戰，後勤是最重要的，尤其是李成梁部，又是騎兵作戰，要詳細制定相應的後勤補給方案，同時要徵調相關的各都司兵力，負責保障官軍的後勤，同時保障官軍的後路。

同時朱載坖還敕令薊鎮和大寧鎮準備倉庫，修建兵站，提前運輸糧秣儲存，保證能夠接濟的上李成梁的大軍，而在商量完了這些事情之後，張居正等人奏請朱載坖回宮，最近朱載坖養病，很多事情都是內閣在處理，朝廷上下議論紛紛，現在太子在外，皇帝又有病，朝廷上下人心浮動，所以張居正等人奏請朱載坖回宮，至少能夠將朝廷安定下來。

朱載坖原本是不想這麼快就回宮的，但是朱載坖考慮到現在又是大慶和徵虜，朝廷現在確實需要鎮靜，還是答應了臣子們請求，決定三日之後回宮，朱載坖重新回宮之後，已經積累了不少的政務要處理，朱載坖只得埋頭在政務之中，同時朱載坖命令內官監修繕養心殿，作為自己日後的休息之所，原本養心殿主要為皇帝起居聽政之外閒居的宮殿，也是皇帝常常用膳的地方，嘉靖十七年才開始修建，後來世宗皇帝長居西苑，實際上還沒有使用過。

朱載坖正是看中了養心殿從未有人居住過這些特性，才決定修葺養心殿，作為自己的日後的休息之所，同時在休整了一段時間之後，朱載坖恢復了狀態，繼續批答奏疏，至於百官奏請的朝會事宜，朱載坖仍舊不予回覆，朱載坖實在是對於朝會沒有任何興趣，除了實在是無法推脫的正旦日大朝會之外，朱載坖一向是不怎麼愛舉行朝會的，朱載坖也經常召見官員。

不過朱載坖召見的官員起碼都是四品以上，對於微末京官，一年只見朱載坖一面那是很正常的事情，雖然這些官員們是多次向朱載坖上疏，請求朱載坖勤御朝講，但是對於這些奏疏，朱載坖一律當廢紙處理，對於朱載坖來說，朝會比上刑還讓他痛苦，即便是當了二十年的皇帝，朱載坖還是不能接受所謂的朝會，尤其是朔望朝，對於朱載坖和一些老臣們來說，簡直是上刑。

每逢朔望日朝會，早朝之前，大臣必須於午夜起床，準備停當之後，前往午門集合。大約寅時初刻，大臣們到達午門外等候。午門乃是紫禁城的正門，中間為御道，平時不開啟，左右兩闕則供當值將軍和宿衛執杖旗校等人的出入。又在左右兩掖各開一門，稱為左、右掖門，這才是百官入朝之門。午門上樓名五鳳，設立有朝鐘朝鼓，由鐘鼓司宦官掌管。

一般在卯時初刻，官員們開始進入皇宮。文官由左掖門進入，武官由右掖門進入，先在金水橋之南根據品級排列好次序。鳴鞭之後，依次過橋，到達奉天門丹墀，文官為左班、武官為右班，在御道兩側相向立侯，稱為起居。在此期間，有負責糾察的御史在旁監督，凡是有咳嗽、吐痰、擁擠或儀態不整的都會被記錄下來，聽候處理。

而作為皇帝的朱載坖，起床時間可以比官員們稍微晚一些，但是也不會太晚，因為朱載坖也要準備，在朔望日朝會中，奉天門上廊內正中設御座，稱為金臺。臺階左右是鐘鼓司的樂隊，殿陛門楯間列錦衣親軍大漢將軍，穿著全服鎧甲，御道左右及文武官員身後則各有校尉和府軍前衛帶刀官握刀站立。

鐘鼓司奏樂，皇帝到達御門，錦衣衛力士撐五傘蓋、四團扇，從東西兩側登上丹墀，立於御座後左右。內使兩人，一人執傘蓋，立於座上，另一人執武備，雜二扇，立於座後正中。朱載坖在奉天門升坐之後，再次鳴鞭，鴻臚寺官員唱入班，左右文武兩班齊頭並進步入御道，此時文官北向西上，武官北向東上，行一拜三叩之禮，是為“大班”。公侯、駙馬、伯自成一班，即所謂的勳戚班，居武官班前而稍離。

百官行禮之後，鴻臚寺官員先出班，對皇帝奏報入京謝恩、離京請辭的官員人數。這些人都是前一天在鴻臚寺報備好的。如果皇帝要召見，那麼便先行入殿覲見；如果皇帝不見，則在庭下或午門之外遙行五拜三叩之禮，行禮之後便算完事了。

接下來就是宣佈邊關是否有戰事，大者宣露布，小者具奏本，俱於早朝未奏事之先宣佈，所以張國威而昭武功也。宣讀完這些之後，才開始奏事，每個官員在奏事之前，“皆預咳一聲”，此稱為“打掃”。在打掃之後，要奏事的官員便邁步出班，到御前跪下奏事，說完之後便重新回到班列。奏事之時不用口語，而是大聲朗讀奏疏。通政司、鴻臚寺官員除了引導官員們奏事之外，有時還需要代讀奏疏，而為了達到“美觀瞻”的效果，一般選取該衙門中符合美姿容和大音聲標準的官員。

一般在這個環節，什麼兩廣等地的官員就容易直接被淘汰，選取鄉音不濃，洪武正韻很標準官員擔任，在奏事之後，由御史上奏早朝期間官員失儀情況。至此，早朝流程也就基本完畢了。鴻臚寺官員“唱”奏事畢，鳴鞭駕興，待聖駕退後，百官亦退，各回衙門蒞事。

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