在陳璘和申時行親自查看了之後，在報知了朱載坖之後，選定了北洋水師的平遠艦作為朱載坖的坐艦，之所以選定平遠艦，是因為平遠艦是北洋水師最新的一艘戰艦，隆慶十五年才剛剛交付北洋水師的，體型也大，達到了三千料，空間大，便於隨扈人員居住。

為了保障朱載坖，將平遠艦上的部分火炮暫時撤下，同時加以整修，錦衣親軍對於艦上的所有水手逐個進行審查，保障水手的絕對可靠。

凌雲翼則是調動官軍和遼鎮鎮水師，沿路護衛，同時官軍在陸地上隨時準備接應，除此之外，凌雲翼還以急遞迅速向內閣告知了此事，請求內閣在天津速調大軍和水師接應。

在一切準備就緒之後，隆慶十六年八月初三日，朱載坖和李皇后登上北洋水師平遠艦，從大連出發，迴鑾京師，這次朱載坖只帶了親近臣子、內侍和少部分錦衣親軍，在北洋水師的護衛之下，前往天津。

北洋水師提督陳璘率領旗艦致遠艦在前開路，岸上的官軍隨時準備接應，而得知朱載坖走海路迴天津，張居正也是有些抓狂，當即命令京營和親軍諸衛前往護駕，還有順天巡撫王錫爵，速調水師，前往接應，務必要保證朱載坖的安全。

朱載坖倒絲毫沒有緊張的意思，上船之後去視察船上的各處，慰問這些水手的，在啟航之前，這些水手們才得知平遠艦成為朱載坖的坐艦，能夠成為的皇帝的坐艦，對於這些水手們來說自然是無比榮耀的事情，對於這些水手們，朱載坖是極為和藹的，他們大部分都和太子差不多大，算起來都可以算是朱載坖的子侄輩。

朱載坖詳細詢問他們的情況，專門記下他們的名字，朱載坖在登艦之前，就已經以皇帝的名義賞賜了這些水手們，然後朱載坖親自詢問這些水手們，甚至命令孟衝將自己所攜帶的點心之類的零食遍賞士卒們，同時命令隨行的廚子就地取材，烹飪食物，朱載坖和這些士卒們一道分享。

朱載坖笑著對這些士卒們說道：“朕還是第一次坐海船，比不得諸位都是久經波濤的。”

見朱載坖如此隨和，這些士卒們也不那麼拘束了，這些士卒們都是長期在海上漂泊的，對於海上的見聞還是不少的，朱載坖也就向他們瞭解他們眼中的各國水師，在這些士卒們眼中，朝鮮、倭國的水師不足為慮，但是西洋的船隻還是確實有可取之處，他們所見到的西洋帆船，航速比大明的要快一些，吃水也深，重心更低，也就是大明的船隻更加穩定，尤其是遠洋作戰的時候，這點就很重要的。

朱載坖認真聽取這些士卒們的意見，對於海上的生活，水手們普遍反映伙食太差，近海航行時還好，能夠及時得到補充，但是一旦遠洋作戰，對於水手們來說就很痛苦了，常年累月沒有淡水河新鮮蔬菜，時刻威脅著這些水手的的生命安全，對於這個問題，朱載坖也表示要考慮，最後總歸是要解決的。

朱載坖對於這些水手們的生活還是很關心，朱載坖很清楚飲食對於水手尤其遠洋水手，飲食還是很重要的，必須要予以滿足的。

朱載坖在北洋水師的護衛之下向天津進發，沿途的官軍在水陸護衛，凌雲路等人更是要將朱載坖船隊每日的行進路線都要詳細奏報，同時順天巡撫王錫爵也命令天津的水師前出匯合，一道護衛朱載坖前往天津。

朱載坖經過九天的航行，終於抵達了天津，順天巡撫王錫爵等人在港口迎接，朱載坖在天津府稍事休息之後，從天津出發回到京師。

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