按照朱載坖的改革，地方有捕快、衙役和巡檢司，就能夠足夠應對地方的一些盜賊流寇了，只要不是特別大的流寇叛軍，地方應該是有足夠的力量來處理這些事情的。
而朝廷駐各地的衛所官軍和鎮協野戰官軍則有其他的任務，衛所官軍主要是屯墾和作為鎮協官軍的預備役，還有從中選拔京操班軍作為常備軍和地方的城防兵力，這些衛所官軍平時由都指揮使負責指揮，對轄區內的城防負責。
而提督、總兵麾下的野戰官軍則是負責抵禦外敵，征戰四方的，由提督、總兵官負責訓練指揮，這些官軍地方官府是無權調動、指揮的，只有被朝廷特賜王命旗牌、令箭的督撫大員才能夠憑藉上諭、詔書指揮相應的官軍在指定的區域作戰，對於地方官府的命令，他們不能接受。
朱載坖同時嚴格軍法，擅調衛所官軍和鎮協官軍百人者，以謀反論處，杜絕地方官府過分掌握武力，在地方出現大規模民變、叛亂的時候，由地方官府向督撫請求之後，督撫可以使用王命旗牌或者令箭等信物，依照職權調動官軍平叛，但是同時必須向練兵軍務處奏報備案，不準擅自調動鎮協官軍，在用衛所官軍能夠解決問題的時候，不得調動鎮協官軍。
這樣的話，朝廷就將地方兵權予以削奪，而對於京營和各地的官軍，由朝廷予以統一排程，兵部負責清查員額，配置軍器，編制軍餉、軍餉等事項，而練兵軍務處則負責監察、接收軍器並且監察質量，督導並監察訓練，保障官軍的戰鬥力。
同時將衛所的訓練、管理、調動等日常事務都劃歸五軍都督府管理，以加強五軍都督府的權力，對於衛所體制，朱載坖也在和重臣們商量了之後還是決定對大明的衛所體制予以重大改革。
大明初年，衛所是官軍的絕對主力，自京師達於郡縣，皆立衛所。外統之都司，內統於五軍都督府，而上下十二衛為天子親軍者不與焉。征伐則命將充總兵官，調衛所軍領之，既旋，則將上民所佩印，官軍各回衛所。作為官軍的主力，衛所官軍在大明統一天下，征討北虜的過程中立下了赫赫戰功。
但是現在的衛所官軍已經早就不是當年的百戰雄師了，屯田多被軍官吞蝕，軍士破產逃亡，所存無幾，且缺乏戰鬥訓練，僅供地主、軍官役使，軍器缺乏，要想全面整頓，朱載坖認為是不可能的，而且也沒有必要，現在朝廷的征戰主力已經是職業制的鎮協官軍了，他們主要承擔野戰任務，衛所官軍的重要性就相對下降了。
按照舊制，軍士都是世襲的，單獨編戶籍，叫作軍戶。凡各地衛、所皆實行屯田，以保證軍餉的供應。軍士分為屯田與守城的兩部分，屯田者專事耕墾，供應軍糧；守城者專務防守操練。軍士守城與屯種的比例大致是邊地三分守城、七分屯種，內地二分守城、八分屯種。
現在衛所一般不再承擔野戰的任務了，朱載坖認為現在衛所的當務之急應該是首先恢復起來，也就是：“清查隱佔，均平糧額，開墾拋荒最為目前急務。”
由兵部、五軍都督府、衛尉寺領頭，對於衛所的軍屯予以清理，同時將部分沒有的土地的流民充為軍戶，編入衛所之中，分給土地，發給農具，令其開墾土地，之前朱載坖就將軍戶的籽粒降到和當地的田賦一樣的水平，同時籽粒的徵收由地方官府負責，剝奪了這些世襲衛所軍官盤剝軍戶的主要途徑。
同時統一規劃，現在天下都司為21個、留守司2個、內外衛493個、千戶所359個，每衛抽調一千人作為脫產軍士，作為地方都司的主要兵力，負責鎮守城池、班操上京，和鎮協官軍享受一樣的待遇，這樣天下的衛所官軍實際的脫產軍士就是四十九萬三千人，除了兩京十六萬班操京軍之外，剩餘的軍士負責駐守駐守各府州縣，用以守衛城池、邊堡、海防等。
衛所軍士和鎮協官軍一樣是朝廷的正規軍，所享受的待遇一致，軍器等也基本一致，除了衛所官軍中的騎兵和重炮編配的很少之外，在其他方面，衛所官軍和朝廷的鎮協官軍都享受一樣的待遇，但是經費來源不同，朝廷的鎮協官軍是有朝廷直接保障軍餉和軍糧、裝備的。
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桃之夭夭，赤符飄飄。
甲子既至，蒼天搖搖。
中平元年，春。涿縣桃花將綻未綻，太平道暗流已如沸鼎。
穿越成大漢魅魔劉備，他知道——一個月後，就是席捲八州、撼動四百年漢祚的黃巾之亂。
也是他這“中山靖王之後”，從涿郡一介白衣，踏上昭烈之路的起點。
這一世，他不再等。
當街弓發三箭，誅殺太平道小帥，奪其甲弩，揭其逆謀。
更以奇貨可居，說動張世平、蘇雙傾財相助。
黃巾之亂一起，他就有上千義兵，在黃巾之亂中嶄露頭角。
群雄討董，他已經身佩青綬銀印，真正參與討董聯盟。
這一次，他重走重走昭烈之路，豈止為偏安一隅？
桃園的烽煙，巨鹿的火光，洛陽的朝堂，徐州的恩義，荊襄的基業，益州的險阻，漢中的對峙，夷陵的遺憾，白帝的託孤……
那些曾讓他輾轉半生、壯志未酬的足跡與傷痛，此生皆要步步為營，一一改寫。
“民能載舟，亦能覆舟。這一次，我要這民心，更要這江山。”
“季漢的旗幟，不當只懸於蜀中一隅。”
“我要這天下人皆知，何謂真正的——炎漢昭烈！”
司馬王，互相揮刀。
北方的蠻子，有肉吃飽了。
這個家庭嚇壞了膽子，都逃到了南方。
人們餓瘋了心，什麼都在鍋里煮。
戰場上的英雄拚命拼搏，宮殿里的貴族尋找樂趣。
兒子殺父，弟弟殺兄，女當奴，男當妾...這個荒誕的時代，全是亂搞。
唐禹：“我只想保護自己，圖個自由逍遙。”
只是，這個荒誕的亂世逃不掉，只能提刀，只能化身火，把一切都燒掉。
逼我御馬監為奴，現在後悔什麼？
侯府世子，皇城麒麟，文濤武略非凡，泗水關前奪城先登！
誰料，林軒當了18年侯府世子，竟是冒名頂替。
名利不保，親情不在，為奴三年，嘗盡心酸。
御馬監三年為奴，林軒看透了一切，寵辱不驚，只想與侯府斷絕一切關係。
但誰知，侯府大家竟然後悔瘋了！
十年為質無人問，一次敗家天下知！
取代弟弟進京為質十多年，回家還要被迫入贅，小爺不伺候！
林楓離家後，燒水泥，做炸藥；鍊鋼，造大炮！
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