隆慶十五年是大明內外製度變革極大的一年，張居正領導的內閣，將一條鞭法、攤丁入畝等朝廷新政在大明全國推開，厲行對於田畝和人口的清查，而朱載坖則在推動朝廷官職的改革。

朱載坖首先是對於刑部進行了拆分，刑部管理天下刑名，事情頗多，原有的官員根本無法承擔這麼繁重的任務，尤其是朱載坖大量建設巡檢司之後，刑部的工作就更加繁忙了，原有的刑部架構已經不能勝任現在的工作了。

之前對於巡檢司的管理是由刑部一名左侍郎擔任提督巡檢衙門，現在巡檢司的實力擴大，全國的巡檢司，人數以萬計，巡檢司是朝廷設定在地方，用以維持治安，加強對於地方控制的重要機構。朱載坖不能夠不重視此事。

朱載坖決定成立專門的巡檢總署，管理大明全國的巡檢司，為了加強巡檢司的戰鬥力，巡檢司的主要人員構成由官軍的退伍士卒和低階軍官構成，同時除了不裝備甲冑和火炮之外，巡檢司的軍器裝備基本和官軍的一致，按照官軍輕步兵的情況予以裝備，巡檢司屬於半軍事化部門，所以必須要重視。同時將刑部督捕司劃歸巡檢總署管理，負責通緝要犯等事宜。

朱載坖決定巡檢總署衙門和六部一樣為正二品衙門，以刑部尚書銜總督巡檢總署，同時為了保證巡檢司的戰鬥力，還以大將一員，充提督巡檢總署，負責大明各巡檢司的訓練、裝備和大規模調動的事宜，同時在各省設立都巡檢使由按察副使擔任，同時為了保證巡檢司的戰鬥力，按照各省巡檢司的數量，配置巡檢參將或巡檢副將，負責本省巡檢司的訓練、裝備、調動等事宜。

而南北兩京作為大明的腹心之地，還要專門設立京師警巡司，直接由巡檢總署管理，兩京的五城兵馬司、巡檢司都統一由巡檢總署直接管理。同時還要釐清地方官府和錦衣親軍之間的權責關係，錦衣親軍是皇帝的耳目，在地方主要負責偵查、蒐集情報，查辦諸如謀反、謀逆、官員貪墨等案件和朱載坖直接交辦的案子，其他一般刑事案件，錦衣親軍不負責處理。

除了刑部之外，還有就是戶部，現在的大明戶部，是大明朝廷各部院中最為龐大的一個部門，因為戶部所負責的事情也確實是大明朝廷非常重要的事情，戶部除了本部之外，還有四個很重要的部門，海關總署衙門，提督鈔關衙門和總理鹽政衙門、總督倉場衙門。

其中海關總署衙門是正二品，其餘都是從二品或者正三品衙門，對於這四個部門，朱載坖認為海關總署和總理鹽政衙門不必再變動了，重要的是鈔關衙門和倉場衙門，朱載坖認為要予以整合改組。

原本提督鈔關衙門僅僅是負責大明的鈔關稅賦，但是現在朱載坖認為應當擴大職權，將一應鈔關、車船、工商業的稅收全部交由該衙門管理，將提督鈔關衙門升格為稅務總署，以戶部尚書銜提督之，為正二品衙門。

而總督倉場衙門和司農寺合署辦公，負責整個大明朝廷和地方的倉儲儲備之事，以戶部尚書銜充總督倉場兼司農寺卿，而在地方則按照地域省份設定巡倉之官，仿宋制設立提舉常平使，以司農少卿兼任，負責地方的糧儲、物價事宜。

這樣一來，戶部除了本衙之外，就是海關總署、稅務總署、總理鹽政、總督倉場四個衙門，是大明六部之中最龐大的部門。

除了戶部的這些附屬機構之外，還有戶部本衙也要予以改組，原本的戶部本衙，由浙江、湖廣、江西、四川、河南、山東、陝西、陝西、廣東、福建、貴州清吏司和其他一些直屬衙門組成，朱載坖認為這種體制不行，首先分省設司，各省都要由相應的清吏司，除了這些分省的清吏司之外，還要設立預算、軍餉、催徵、太倉、督察等司，負責朝廷的相關業務。

而對於工部也要實施相應的改革，將原本工部下設營繕、虞衡、都水、屯田四清吏司，現在朱載坖將都水司單獨拿出來，將都水司升格為都水監，負責大明全國的河道、水利之事，以工部左侍郎兼任之，同時在工部中設立礦冶司，負責管理全國的礦冶生產。

。的視重分十是然當坖載朱，事的才人舉選到及涉，事大之國是這，試考是其尤，了泛寬於過些有為認坖載朱，理管要都部禮，祀祭、外、儀禮、試考從，法之舉貢校學及制儀之禮五管掌，的泛寬最圍範理管中部六明大是部禮，了理管的部禮於對是就後然

。使院試考任兼郎侍右部禮以，責負院試考由都，等試考的流選考員吏，試考取選的員吏有還，試殿、試會的廷朝到試鄉、試縣的方地從，試考級各責負門專，院試考立設定決坖載朱

。系理管校學的整完套一構們員等政學督提的方地與，院書校學的下天明大理管責負門專，司院學設下部禮在，度制的校學理管的整完套整一起立建要廷朝為認坖載朱，門部的校學理管門專有沒並，務事外和祀祭、儀禮的廷朝責負是要主，司吏清四膳、客主、祭祠、制儀有僅在現部禮，了事的校學是就，外之試考了除

。授選遷升的吏武文下天掌執責負，院選銓外流和部本部吏是舊仍，變不持維是則部吏

。事此量商道一們臣重集召是而，策決出作目盲有沒坖載朱，麼什是該應底到權可許的部兵是但，權之部兵奪削，衡制以予來務軍兵練立設在以所坖載朱，重過力權部兵明大的在現得使，了奪削以予全完權之揮指、練訓的府督都軍五於屬本原將，重過力權是定肯部兵的在現，說來坖載朱從，角樣麼什個一演扮當應部兵，楚清考思有沒還坖載朱，了門部的煩麻較比個一是就部兵而