陶謙去世後，曹操打算趁機攻取徐州，回頭再來平定呂布。荀彧勸諫道：“昔日，漢高祖憑藉關中作為根基，光武帝依靠河內之地站穩腳跟，他們都是透過鞏固根本，以此來掌控天下。進，足以戰勝敵人；退，也能夠堅守陣地。所以即便經歷困境、遭遇失敗，最終還是成就了大業。將軍您最初在兗州起兵，平定了山東地區的禍亂，百姓們對您心悅誠服。況且黃河、濟水一帶，乃是天下的戰略要地。如今雖說這一地區有所殘破，但仍然比較容易據守自保，這裡就如同將軍您的關中、河內，是萬萬不可不先穩固的。如今已經擊敗了李封、薛蘭，如果分兵向東攻打陳宮，陳宮必定不敢再向西進犯。我們正好可以利用這段時間，組織兵力收割成熟的麥子，節省糧食、儲存穀物，如此一來，一舉便可擊敗呂布。打敗呂布之後，再向南與揚州方面結盟，共同討伐袁術，進而兵臨淮水、泗水一帶。倘若捨棄呂布，向東進攻徐州，留下過多兵力則不夠用來攻打徐州，留下太少兵力又會導致百姓都據城自保，連砍柴都無法進行。呂布要是趁機趁虛而入，肆意侵擾，民心將會更加不穩。到那時，恐怕只有鄄城、范縣、衛縣還能保全，其餘地方都將不再為我們所有，這樣一來，兗州也就沒了。要是徐州沒能平定，將軍您又能回到哪裡去呢？況且，陶謙雖然死了，但徐州並非那麼容易被攻克。他們有了往年戰敗的教訓，必定會因為恐懼而相互結盟，彼此呼應、互為表裡。如今東方地區的麥子都已經收割完畢，他們一定會堅壁清野，等待將軍您前去。將軍您要是去攻打，卻無法攻克城池，想要劫掠物資，又一無所獲，不出十天，十萬大軍還未交戰，便會自行陷入困境。（臣松之認為，當時徐州尚未平定，兗州又發生叛亂，此時提到十萬之眾，雖說有誇張的成分，但也說明軍隊並非人數稀少。由此更能知道，官渡之戰時，曹操的兵力絕不可能不滿萬人。）之前攻打徐州時，咱們實施了嚴厲的懲罰措施（據《曹瞞傳》記載：自從京師遭遇董卓之亂，百姓紛紛向東流亡，大多聚集在彭城一帶。曹操大軍到達後，在泗水河邊坑殺了男女數萬人，以至於泗水都因屍體堵塞而斷流。陶謙率領他的軍隊駐守在武原，曹操無法前進，便率軍從泗南攻打慮縣、睢陵、夏丘等縣，所到之處皆進行屠殺，連雞犬都未能倖免，城中一片荒蕪，不見行人。），徐州百姓的子弟們念及父兄所遭受的恥辱，必定人人都會拼死守城，絕無投降的想法。就算咱們能夠攻破徐州，也難以真正佔有它。凡事本就有捨棄一方而謀取另一方的情況，但前提是用大的利益去交換小的利益，用安穩的局面去取代危險的處境，或者權衡一時的形勢，並且不用擔心根基不穩。可如今這三種情況都對我們不利，還望將軍您仔細斟酌。”曹操聽後，便放棄了攻打徐州的計劃。他組織軍隊大規模收割麥子，之後再次與呂布交戰，同時分兵平定各個縣城。最終，呂布戰敗逃走，兗州也得以平定。

建安元年，曹操擊敗黃巾軍。此時，漢獻帝從河東返回洛陽。曹操就奉迎天子並遷都許昌一事進行商議，有人認為山東地區尚未平定，韓暹、楊奉剛剛護送天子抵達洛陽，還與北面的張楊聯合，目前還無法立刻控制局勢。荀彧則勸說曹操：“昔日，晉文公接納周襄王，諸侯們紛紛像影子一樣追隨他；漢高祖為義帝發喪，身著白色喪服，使得天下人心歸附。自從天子流亡在外，將軍您最先倡導起兵勤王，只是因為山東地區局勢混亂，無法長途跋涉前往關右護駕。即便如此，您仍然分派將帥，冒著危險與朝廷互通使者。雖然在外抵禦禍亂，但您的心始終繫於王室，這正是您匡扶天下的一貫志向。如今，天子的車駕返回洛陽，可洛陽城卻荒蕪破敗。忠義之士有著匡復漢室的想法，百姓們也因感懷往昔而更加哀傷。如果能在此時奉迎天子，順應百姓的期望，這是大順之道；秉持公正無私的態度，以此來使各路豪傑信服，這是深謀大略；弘揚正義，吸引天下英才前來歸附，這是大德之舉。天下即便有叛逆之人，也必定無法對我們造成阻礙，這是顯而易見的。韓暹、楊奉又怎敢加害我們！倘若不及時做出決定，四方的勢力一旦有了別的心思，日後再考慮這件事，就來不及了。”曹操聽後，便率軍前往洛陽，奉迎天子遷都許昌。天子任命曹操為大將軍，同時晉升荀彧為漢侍中，兼任尚書令。荀彧常常在朝中秉持穩重的行事風格（據《典略》記載：荀彧禮賢下士，為了接待賢才，常常坐不安席。他在尚書檯任職時，從不因個人私慾而影響自己的判斷。荀彧有一位堂兄弟，才能和品行都很平庸，有人對荀彧說：“以您現在的地位，難道不應該讓他做個議郎嗎？”荀彧笑著回答：“官職是用來彰顯才能的，如果按照你說的做，眾人會怎麼看我呢！”他就是這樣秉持公正之心。），曹操雖然在外征戰，但軍中事務和國家大事都會與荀彧一同謀劃（據《典略》記載：荀彧容貌俊美。另外，在《平原禰衡傳》中記載：禰衡字正平，建安初年，他從荊州北上前往許都。禰衡自恃才華出眾，性格傲慢，對人評價往往言過其實，遇到不如自己的人，便不屑與之交談，因此人們都很厭惡他。唯有少府孔融看重他的才能，上書向曹操舉薦禰衡，書中寫道：“禰衡資質美好，品格堅貞，才華卓越出眾。剛剛涉獵文學藝術，便能深入領悟其中的精妙之處；凡是眼睛看過一遍的內容，就能誦讀出來，耳朵短暫聽到的話語，也能牢記於心。他的性情與大道相契合，思維敏捷如同有神助。桑弘羊善於計算，張安世記憶力超群，與禰衡相比，也不足為奇。”當時禰衡年僅二十四歲。那時許都剛剛建立，人才濟濟。禰衡曾寫好一張名帖帶在身上，可時間久了，名帖上的字跡都模糊不清了，也不知道該去拜訪誰。有人問他：“為什麼不去投奔陳群（字長文）、司馬朗（字伯達）呢？”禰衡回答道：“你竟然想讓我跟那些市井之徒為伍！”那人又問：“當今許都之中，誰是最值得結交的人呢？”禰衡說：“大兒是孔文舉（孔融），小兒是楊德祖（楊修）。”那人接著問：“曹操、荀令君（荀彧）、趙蕩寇（趙儼）都算得上是蓋世之才吧？”禰衡對曹操評價並不高；又看到荀彧容貌出眾，趙儼身材高大，便回應道：“文若（荀彧）的臉可以借來去弔喪，稚長（趙儼）可以派去監廚請客。”他的意思是荀彧徒有外表，而趙儼只知道貪吃。於是眾人都對禰衡恨得咬牙切齒。禰衡知道大家對他不滿，便打算南下返回荊州。臨行前，眾人在城南為他餞行，事先設定了供帳，並相互告誡：“禰衡多次出言不遜，等他來晚了，我們就坐著不起來，以此作為回應。”等禰衡到了，眾人果然都坐著不動。禰衡見狀，便放聲大哭。眾人問他為何如此，禰衡說：“在這一群行屍走肉之間，能不讓人感到悲哀嗎？”禰衡南下見到劉表，劉表對他以禮相待。將軍黃祖駐紮在夏口，黃祖的兒子黃射與禰衡交好，禰衡便跟隨黃射到了夏口。黃祖欣賞禰衡的才華，每當席中有貴賓時，就會讓禰衡與他們交談。後來禰衡變得驕橫傲慢，回答黃祖的話時，言辭輕慢，黃祖認為禰衡是在辱罵自己，大怒之下，命令侍從將禰衡拉出去。左右的人便把禰衡架了出去，最終將他殺害。臣松之因為本傳中沒有提及荀彧的容貌，所以在這裡引用《典略》和《禰衡傳》的內容來說明。另外，潘勖為荀彧撰寫的碑文裡，稱讚荀彧“容貌英俊，儀表不凡”。《張衡文士傳》記載：孔融多次向曹操舉薦禰衡，希望曹操能與禰衡見面，可禰衡厭惡曹操，心中常常憤懣不平。因為禰衡患有狂疾，不肯前往，還多次發表不當言論。曹操聽聞他的名聲，想要羞辱他一番，便任命他為鼓史。後來到了八月初一，曹操大宴賓客，眾人齊聚一堂。當時，按照規矩，鼓史擊鼓完畢後，都要脫下舊衣服，換上新衣。輪到禰衡擊鼓時，他演奏了一曲《漁陽參撾》，神情姿態與眾不同，節奏精妙絕倫。在座的賓客聽了，無不情緒激昂。禰衡演奏完後，卻沒有換衣服，官吏上前呵斥他，禰衡竟然當著曹操的面，一件一件地脫下衣服，裸身站立，然後慢悠悠地穿上褲子、戴上帽子，穿戴整齊後，又接著擊鼓演奏《漁陽參撾》，臉上毫無羞愧之色。曹操見狀，大笑著對在座的人說：“我本來想羞辱禰衡，沒想到反被他羞辱了。”如今流傳的《漁陽參撾》，就是禰衡創作的。孔融嚴厲地責備了禰衡，並傳達了曹操的意思，希望禰衡能與曹操見面。禰衡答應了，說：“我會為了你去見他。”到了十月初一，孔融先去見曹操，說禰衡想要來拜見。可一直等到天色已晚，禰衡穿著粗布單衣，戴著粗布頭巾，腳蹬草鞋，坐在曹操的軍營門外，用手杖捶打著地面，大聲辱罵曹操。曹操下令讓外面的馬廄立刻準備三匹精良的馬，派兩名騎兵護送，然後對孔融說：“禰衡這個小子，竟敢如此放肆！我殺了他就如同殺死一隻麻雀、一隻老鼠那樣容易，但這個人向來有些虛名，遠近皆知。如今要是殺了他，別人會說我心胸狹隘，容不下人。現在把他送給劉表，看看最終會怎麼樣。”於是命令騎兵把禰衡架到馬上，由兩名騎兵挾持著送到南陽。《傅子》記載：禰衡能言善辯，但言辭過於尖刻。他見到荊州牧劉表時，極力與劉表結交，劉表很高興，把他當作上賓對待。禰衡對劉表的讚美之詞不絕於口，但對劉表身邊的人卻毫不留情地批評。於是，劉表身邊的人便趁機詆譭禰衡，他們對劉表說：“禰衡稱讚將軍您的仁德，連西伯侯都比不上，只是認為您做事不夠果斷；最終不能成就大業，必定是因為這個原因。”實際上，這些話是在指責劉表才智不足，並非禰衡的本意。劉表沒有仔細調查，便疏遠了禰衡，將他趕走。禰衡與劉表絕交，又在黃祖那裡施展不出才華，最終身死名滅，成為天下人的笑柄，這都是那些詆譭他的人造成的。）。

曹操問荀彧：“誰能夠代替你為我出謀劃策呢？”荀彧回答說：“荀攸、鍾繇可以。”在此之前，荀彧舉薦謀士時，推薦過戲志才。戲志才去世後，他又推薦了郭嘉。曹操認為荀彧很有識人之明，他所舉薦的人都很稱職，只有嚴象擔任揚州刺史、韋康擔任涼州刺史時，後來遭遇了失敗身亡的結局。（據《三輔決錄注》記載：嚴象字文則，是京兆人。他年少時聰慧博學，有膽有識。以督軍御史中丞的身份前往揚州討伐袁術，恰逢袁術病逝，於是他便被任命為揚州刺史。建安五年，嚴象被孫策的廬江太守李術殺害，年僅三十八歲。嚴象的同郡人趙岐撰寫了《三輔決錄》，他擔心當時的人不能完全理解他的意圖，所以將這本書藏了起來，只給嚴象看過。韋康字元將，也是京兆人。孔融在給韋康的父親韋端的信中寫道：“之前元將（韋康）前來，我發現他才華出眾，品德高尚，風度高雅，志向遠大，是當世的傑出人才。昨日仲將（韋誕）又來，他性情忠厚老實，文思敏捷，為人誠懇，是能夠守護家族的人。沒想到，您這隻老蚌，竟然孕育出兩顆如此珍貴的珍珠，實在令人珍視。”韋端從涼州牧的職位上被徵召為太僕，韋康接替他擔任涼州刺史，當時的人都認為這是很榮耀的事。後來，韋康被馬超圍困，堅守了很長時間，但救援的軍隊一直沒有趕到，最終被馬超殺害。仲將就是韋誕，他的事蹟在《劉邵傳》中有記載。）