許銘連忙開啟電腦，調出他們三個多月的心血，一個簡陋的軟體雛形，裡面佈滿了密密麻麻的程式碼和資料，還有很多標註的錯誤和疑問。
肖宿快速瀏覽著，手指在鍵盤上輕輕敲擊，偶爾停下來打量一下。
一旁的許銘緊張的看著他，連呼吸都變輕了許多。
“你們第一步算的是什麼？”肖宿問。
“分子座標，從輸入檔案裡讀取原子型別和核座標，然後構造成距離矩陣。”
“距離矩陣之後呢？”
許銘猶豫了一下。
“按照論文裡的思路，我們把距離矩陣對映到辛幾何空間，這一步我們卡了很久，因為映射出來的結構總是不對。後來又參考了顧辛幾何那篇論文裡關於拉格朗日子流形的構造方法，才算勉強跑通了。”
肖宿沒有評價勉強跑通這西個字。
他把幾何對映模組的程式碼展開，螢幕上出現了大約三百行C++。
他的目光從函式簽名開始往下走，在某一行停了下來。
“這裡，你們在構造辛流形的時候，首接把原子核座標當成了辛流形上的點。
但論文裡寫的是把電子密度分佈視為辛流形上的一個截面，化學鍵對應的是這個截面上的拉格朗日子流形。
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