事變結束，李淵被迫立李世民為皇太子，不久後禪位，唐太宗正式登基。論功行賞，段志玄作為玄武門核心功臣，一路升遷至左驍衛大將軍，封樊國公，賞賜實封九百戶，擁有實實在在的食邑，手握皇城禁軍兵權，負責皇宮外圍防務，是太宗最放心的宿衛大將。

貞觀初年，天下初定，朝堂之上文武百官各安其職，邊境游牧民族時常南下侵擾，吐谷渾屢屢進犯河西走廊，劫掠商旅、侵佔州縣，太宗決意出兵懲戒，任命段志玄為西海道行軍總管，統領西北各路大軍出征吐谷渾。

大軍抵達青海境內，吐谷渾部落聽聞段志玄領兵前來，自知不敵，連夜驅趕牧馬、部族牲畜向西逃竄，留下大片牧場與馬匹。部下紛紛建議即刻率軍追擊，繳獲敵軍牲畜，重創吐谷渾主力，段志玄卻冷靜判斷：敵軍主動撤退，必定設有伏兵，貿然追擊容易落入圈套，於是按兵不動，原地駐紮固守，沒有貿然出兵。

朝廷御史得知此事，上奏彈劾段志玄逗留不前、錯失戰機，太宗短暫下詔問責，派人前來問詢。段志玄沒有為自己過多辯解，只陳述敵軍設伏的實情，隨後靜待時機。沒過幾日，吐谷渾果然派遣小股部隊折返試探，段志玄抓住機會，全軍突襲，大敗吐谷渾部落，繳獲數萬匹牧馬，徹底擊潰河西邊境的侵擾勢力，向朝廷證明自己按兵不動並非怯戰，而是穩妥佈局。此戰過後，太宗更加認可段志玄沉穩持重的領兵風格，知曉他並非只懂衝鋒的莽將，兼具統籌全域性的將帥之才。

貞觀八年，長孫文德皇后駕崩，舉國治喪，太宗下詔，令段志玄與宇文士及二人分別統領禁軍，駐守肅章門，管控喪葬期間皇城內外兵馬，嚴守門禁，禁止無關人員隨意出入，安保事務全權交由二人處置。

一日深夜，太宗掛念喪禮相關事宜，派遣宮中宦官攜帶親筆手敕，前往軍營傳喚兩位將軍入宮議事。宦官率先抵達宇文士及營寨，通報是天子使者深夜傳旨，宇文士及立刻下令開啟營門，親自出門迎接使者，全程毫無阻攔。

宦官隨後前往段志玄駐守的營寨，叩擊營門，表明持有皇帝手敕，要求立刻開門放行。誰料營門緊閉，守衛士兵傳報段志玄指令：“軍門夜晚不可隨意開啟，無論何人，一律不得入內。”

宦官在門外高聲呼喊：“此乃陛下親筆敕令，事關宮中要事，耽擱不得！”

段志玄立於營牆之上，隔著大門沉聲回覆：“夜色深沉，無法辨別敕令與使者真偽，軍中規矩不可破，待到天明，方可開門核驗詔令。”

任憑宦官在門外百般勸說、拿出天子名號施壓，段志玄始終不肯鬆口，整整一夜緊閉營門，任由使者在門外等候，直至第二日天光破曉，才打開營門，仔細查驗手敕，確認無誤後才接待宦官。

此事傳入唐太宗耳中，太宗非但沒有惱怒段志玄深夜抗旨不給自己顏面，反倒滿心讚歎，對身邊近臣感慨：“段志玄才是真正的將軍，當年西漢周亞夫細柳營治軍嚴明，也無法超過他。”

周亞夫是西漢名將，駐守細柳營時拒絕漢文帝深夜入營，成為千古治軍典範，太宗將段志玄與之比肩，是極高的評價。經此一事，滿朝文武皆知段志玄軍紀如山，公私分明，即便面對帝王旨意，也絕不破壞軍中法度，剛正風骨傳遍長安。

貞觀十一年，太宗推行世襲刺史制度，封賞開國功臣世襲封地，段志玄改封褒國公，兼任金州刺史，子孫可世襲爵位封地，榮耀至極。此後兩年，接連升任右衛大將軍、鎮軍大將軍，武將官階抵達頂峰，常年手握皇城重兵，負責帝王宿衛，太宗出入行宮、外出巡獵，常令段志玄領兵護駕，安危盡數託付於他。

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。榮氏段淄臨續延，承傳行並風武與脈文族家，珪段子三、瓘段子次、瓚段子長，子三有育生一玄志段

。任信宗玄唐深，宮東奉侍，事詹子太拜間年元開，位爵襲承簡懷段子之瓚段。高頗價評野朝，度法守恪，正公謹嚴，玄志段似酷格風軍治，地重關潼守鎮，責職的城皇衛宿年當親父刻復，軍將大衛屯左至期時政執天則武，軍投後年，武勇一親父承繼，位爵公國褒襲承瓚段子長

。進並頭齊支分武文，書文制禮掌執部禮堂朝在，中郎部禮至本懷段，軍參州德任昶懷段，出輩才人中之輩孫。序秩方地定穩，姓百南江安善妥，務政方地南江掌執，史長州宣任出珪段子三；績政有頗，姓百恤方地理治，廉清為，令縣邑朝任歷，路道文走瓘段子次

。料史貴珍量海下留究研史文世後為，今至傳流，作之峰巔學文記筆代唐是，故典聞奇下天羅包，》俎雜酉《奇傳記筆下寫，式段子之昌文段；治吏通，眾出采文，年餘十政朝掌執，相宰拜間年宗穆唐，昌文段孫世七玄志段。家大的史青垂名位兩生誕期時唐晚中，族壇文型轉家世武文從，澱沉代幾經歷，勳功將武唐初於步止未並族家氏段