還有一次，崇禎因為聽信了奸臣的讒言，想處死正直的大臣袁崇煥。周皇后知道後，趕緊勸崇禎：“皇上，袁崇煥是鎮守遼東的大將，要是殺了他，誰來抵擋後金的鐵騎？而且袁崇煥有沒有謀反，還沒查清楚，您可不能輕信讒言，錯殺忠良啊。”

可惜的是，當時的崇禎已經被各種壞訊息衝昏了頭腦，沒有聽進周皇后的勸告，最終還是處死了袁崇煥。後來，後金鐵騎因為沒了袁崇煥的阻擋，多次南下騷擾，崇禎這才後悔不已，經常跟周皇后說：“當初要是聽了你的話，就不會有今天的局面了。”

周皇后不僅關心朝政，還很重視子女的教育。她和崇禎有三個兒子：太子朱慈烺、定王朱慈炯、永王朱慈炤。周皇后對這三個兒子要求非常嚴格，每天天不亮就叫他們起床讀書，還親自檢查他們的功課。她經常對兒子們說：“你們是大明的皇子，將來要為國家出力。現在不好好讀書，不學本事，將來怎麼能擔當大任？”

有一次，太子朱慈烺因為貪玩，沒完成當天的功課，還撒謊說自己背下來了。周皇后知道後，沒有打罵他，而是把他叫到面前，嚴肅地說：“你父親每天為了國家大事，愁得吃不下飯、睡不著覺，你作為太子，不僅不體諒父親，還撒謊騙我。將來讓你繼承大統，怎麼當個好皇帝？”

朱慈烺被母親的話嚇到了，趕緊承認了錯誤，還主動把沒背下來的內容抄了十遍。從那以後，朱慈烺再也不敢貪玩，學習也越來越認真。後來，即使在明朝滅亡前夕，太子朱慈烺依然保持著良好的習慣，還試圖組織兵力反抗李自成，可惜最終還是失敗了。

崇禎十七年（1644年），是大明王朝的最後一年，也是周皇后生命中的最後一年。這一年，李自成的農民起義軍勢如破竹，一路打到了北京城下；而崇禎皇帝，雖然拼盡全力抵抗，卻因為手下的大臣要麼貪生怕死，要麼互相推諉，始終沒能組織起有效的防禦。

三月十七日，李自成的起義軍開始攻打北京內城，炮聲、喊殺聲此起彼伏，整個紫禁城都籠罩在恐懼之中。宮女太監們四處逃竄，有的甚至翻牆逃跑；大臣們更是跑得無影無蹤，只有少數幾個忠臣還陪在崇禎身邊。

當天晚上，崇禎皇帝來到坤寧宮，看到周皇后正平靜地收拾著東西——她把自己和崇禎的衣服疊得整整齊齊，還把太子、定王、永王的衣物打包好，準備讓太監送到外戚家裡躲藏。

崇禎看著周皇后，眼淚忍不住流了下來：“皇后，朕對不起你，對不起大明的列祖列宗。北京要破了，咱們的好日子到頭了。”周皇后也紅了眼眶，但還是強忍著淚水說：“皇上，臣妾嫁給您十七年，從來沒有後悔過。如今國破家亡，臣妾絕不會苟活，一定會陪著皇上。只是太子和兩位王爺還小，您一定要想辦法讓他們活下去，將來或許還有復國的希望。”

崇禎點了點頭，立刻讓人把太子朱慈烺、定王朱慈炯、永王朱慈炤送到外戚周奎、田弘遇家裡躲藏。然後，他又來到坤寧宮，跟周皇后做最後的告別。

周皇后看著崇禎，輕聲說：“皇上，臣妾先走一步，在九泉之下等您。您是大明的皇帝，絕不能被反賊俘虜，一定要保住大明的尊嚴。”說完，她轉身走進內室，關上房門，用一條白綾結束了自己的生命，享年三十六歲。

據《明季北略》記載，周皇后臨死前，還對身邊的宮女說：“我大明二百七十七年江山，今日亡矣，我何忍獨生！”這句話，既是她對大明的忠誠，也是她對自己命運的無奈。

崇禎皇帝聽到周皇后去世的訊息，悲痛欲絕，他衝進內室，看著周皇后的遺體，哭著說：“皇后，你做得對，朕這就來陪你。”然後，他又來到袁貴妃的寢宮，讓袁貴妃殉國。袁貴妃不忍心，想自殺卻沒有成功，崇禎皇帝只好拔出劍，砍傷了她（後來袁貴妃被李自成的起義軍救了下來，順治年間病逝）。

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