在之前朱載坖已經命令軍器監將已經生產好的相關武器裝備和口糧等物資儘快發運到西域，希望能夠幫助到李成梁，除了這些物資上的幫助之外，朱載坖還準備透過外交處理這各問題，朱載坖命令加張學顏兵部尚書銜，為欽差特使，出使順義王，希望透過外交的形式來處理西域的問題。

因為現在衛拉特四部中信仰格魯派的人很多，尤其是這些上層臺吉們，他們之中的很多人都是信奉格魯派的，從前元起，受中原地區影響，蒙古地區信奉佛教。元代自忽必烈開始，由西藏傳入紅帽派喇嘛教，主要傳播於上層貴族。但薩滿教在蒙古民間和貴族中仍有影響。大明建立之後，瓦剌出於政治考量崇尚喇嘛教。而到了現在，格魯派喇嘛教在蒙古地區迅速擴充套件，不僅僅是土默特部、土蠻等部信奉格魯派，和碩特部也信奉格魯派。

而在之前的索南加措去世之後，繼任他活佛和朵兒只唱稱號的是雲丹嘉措，這位的身份可是極為尊貴的，生於蒙古土默特部，父名蘇密爾臺吉，是順義王俺答汗之曾孫。其母名拜罕·珠拉，是成吉思汗之弟哈撒爾十世孫諾諾·衛徵諾顏之女。而他的祖父就是俺答汗的長子辛愛黃臺吉，父母都具有黃金血脈，當真是貴不可言。

他在被被認定為三世達賴喇嘛的轉世靈童以後，取法名雲丹嘉措。這位活佛既是格魯派的宗教領袖，更是蒙古黃金血脈的所有者，其身份之尊貴，可想而知，他在出生後先由土默特部王公貴族及三世達賴喇嘛的管家楚臣嘉措等認為是三世達賴喇嘛索南嘉措的轉世靈童，由班覺嘉措寫信給烏斯藏和大明朝廷，敘述他的靈異情狀，請求派代表前來查訪。

而經過朝廷縝密的程式和金瓶掣籤之後，確定了他活佛轉世靈童的身份，然後再朝廷欽差和蒙古、烏斯藏的代表共同見證之下，具本朱載坖，確認其轉世靈童的身份，由朱載坖親自下旨予以明確，為了確認他轉世靈童的身份，烏斯藏派出索南嘉措的強佐貝丹嘉措及帕木竹巴政權首領的代表等人率甘丹、哲蚌、色拉三大寺僧眾代表前去蒙古核查及迎請，臨行時卸任甘丹赤巴班覺嘉措以格魯派年齡最大的僧人的名義，給靈童起名為雲丹嘉措，表明已經確認了靈童的地位。

但是由於活佛現在年紀尚小，朱載坖特旨命令暫留土默特部，著順義王和忠順夫人予以照看，所以這次朱載坖這次才派出張學顏為欽差出使土默特部，希望利用土默特部透過外交的方式來解決大明在西域的戰事。尤其是土默特部和和碩特部的關係是非同尋常的，雖然大明現在是要打和碩特部並且將其逐出烏魯木齊地區，但是並不意味著要與和碩特部不死不休。

而正相反的是，朱載坖認為和碩特部是大明在西域潛在和盟友，首先在衛拉特蒙古四部之中，只有和碩特部並不是原來的瓦剌部出身，和碩特部和土默特部一樣，同出於成吉思汗的孛兒只斤氏，和其餘三部出身了綽羅斯氏是不同的，而且和碩特部同樣信奉格魯派，和土默特部既是同宗同源，又是信仰一致，所以之前俺答汗才會支援和碩特部成為衛拉特之主的。

但是和碩特部和其餘三部的矛盾是極大的，主要就是以土默特部、土蠻部、和碩特部為首的東蒙古韃靼部和綽羅斯瓦剌部的矛盾，從洪武二十一年起，雙方就因為汗位的歸屬問題大打出手，東蒙古各部仍舊以忽必烈的後代為大汗的正朔，而瓦剌等部則是支援阿里不哥的後代，雙方几經交戰，汗位又回到忽必烈系額勒伯克汗手中，瓦剌封建主和阿里不哥後裔為奪回汗位，於是有瓦剌領主烏格齊哈什哈以可汗政治腐敗、殺弟奪妃為由，於洪武二十七年舉兵弒汗，並扶持阿里不哥後裔坤帖木兒繼承汗位，瓦剌由此掌握蒙古實權。

從此之後，所謂蒙古大汗的權威就不復存在了，即便是後來的蒙古大汗，也很難號令整個蒙古諸部了，知道瓦剌部的脫歡和也先父子，他們即太師位後，繼續聯合東蒙古大汗脫脫不花，拉攏或征服周圍諸侯，並以兀良哈三衛和沙州等衛為左右翼伺機包圍中原。同時以聯姻、封爵間或武力壓制等手段拉攏人心、控制西陲要道哈密，聯結哈密以東的沙州、罕東、赤斤蒙古諸衛，控制西域貿易要道。向西也先多次與察合臺后王作戰，迫使其部落遷徙。而瓦剌北部的乞兒吉思時而臣屬東蒙古，時而從屬瓦剌。瓦剌聯合東西，鞏固兩翼的策略瓦解了太祖、成祖時為牽制蒙古而設定的西北諸衛和東北兀良哈三衛，聲威大震。

但是也將瓦剌和韃靼的矛盾激化到了不可調和的狀態，也先本就與脫脫不花向不相睦。脫脫不花名義上雖然是大汗，但實際權力卻操在也先手裡。也先自恃勢強，垂涎汗位，脫脫不花的妻子是也先的姐姐，也先想要立自己姐姐的兒子為太子，但是脫脫不花拒絕了，雙方發生激烈戰爭。也先也懷疑脫脫不花和明朝相通，想要謀殺自己，所以進攻脫脫不花。脫脫不花戰敗逃走，也先派兵追殺他，捉拿了脫脫不花的妻子和孩子，把他的僕人和牲畜分發給諸部屬；而且乘勝迫脅周圍的各個部落，東到建州、兀良哈，西到赤斤蒙古、哈密，都成了瓦剌的藩屬，瓦剌的勢力由此達到最盛。

而也先則乾脆打破了只有黃金血脈才能夠繼承蒙古大汗的慣例，自稱“大元田盛大可汗”，建號“添元”，以次子阿失帖木兒為太師，這導致了整個蒙古的反抗，阿剌知院在襲殺也先的時候，阿剌便率部眾三萬人直趨也先居所，歷數也先三罪：“漢兒人血在汝身上、脫脫不花王血也在汝身上、兀良哈人血也在汝身上，天道好還，今日輪到汝死矣！”

對於也先僭號一事，整個東蒙古視瓦剌為生死仇敵，不共戴天，所以從小王子開始，歷代東蒙古大汗，只要統一了東蒙古，第一件事就是征討瓦剌。