朱載坖一方面命令吏部和相關的部院衙門清理核實大明現在所有的文官和職務，同時和內閣，還有部院堂官還有地方督撫商量，朱載坖要釐清大明的中央和地方官制，各衙門，還有省道府州縣的各級官員，內設機構也都要予以編定，既要保證朝廷對於地方的嚴格控制，又要控制官員的數量，釐清各部門的權責。

首先當然是大明的一縣之地，作為朝廷最基層的衙門，縣是很重要的，州縣官員都是親民官，其職能涵蓋地方行政、司法及教化，透過分田裡、令貢賦等方式行使治理權 。州縣官需體恤民隱、親自處理實務，建立官民間的擬製血親關係與情感聯結 。親民官的施政行為直接影響民生，如革除弊政、調整稅賦，成為朝廷政策的實際執行者。

歷朝歷代對於這些州縣親民官都是極為重視的，朱載坖也同樣重視這些州縣官員，以大明之前的一縣之地來說，設知縣一員，掌管全縣政令；縣丞一員，掌管糧司、徵稅；主簿一員，掌管戶籍、巡捕；典史一員，掌管緝盜、盤詰、監察、獄囚；稅課大使一員，掌管商稅；教諭、訓導一員，掌管教育、選舉；驛丞一員，掌管郵遞；另有陰陽訓術、醫學訓科、僧會司、道會司、急遞鋪等職能部門，各執其事。

後來朱載坖又增加了縣尉一員，專司刑獄，將主簿的刑獄、安定地方的權力交給了縣尉，由縣尉負責地方的兵防、刑獄之事，但是這個縣衙的配置也並不是一定，朱載坖和內閣、吏部等相關衙門還有地方督撫也要一道商量，對於一些地位重要，賦稅眾多，還有處於交通要道的縣，要根據實際情況配置官員。

如東南等賦稅、訴訟繁雜的州縣，要設定專員來管理這些事情，要根據實際情況，配置管糧主簿，專門負責賦稅的徵收，協助縣令、縣丞徵收賦稅，保證朝廷的賦稅地方的訴訟能夠得到有效的處理，同時為了加強對於地方的控制，還要將鄉里的事務直接交由主簿等佐貳官處理，增加典史，直接管理鄉一級的政務，將朝廷的行政機構直接下放到鄉里，加強朝廷對於地方的控制，結束皇權不下縣的傳統，剝奪這些地方士紳們干預縣政的權力。

除了官之外，對於縣衙來說，還有數量龐大的吏員和書算、雜役等人員，吏員是由朝廷任用、在吏部註冊、地位低於官的公職人員，大致相當於現在的公務員。

書算包括書手、算手，書手又有主文、貼書等多種稱呼，是從百姓中僉僱，輔助吏員辦理文書、會計事務的人員，大致相當於現在的事業編。雜役多從事跑腿、緝捕盜賊、收稅等苦力工作，大致相當於現在的輔警。

對於一縣之地的行政來說，吏員是十分重要的，官主決策，吏負責具體執行。大量的刑名、錢穀、行移文書等工作是依靠吏員來完成的。基本上具體的行政事務都是有這些吏員包辦的，所以這些吏員在基層的行政中也是極為重要的，根據吏部的統計，現在大明一共的經制吏員是六萬八千餘人，大部分都供職於地方州縣衙門。

吏主要在縣衙的各房科中辦事，處理案牘文移事務。縣衙大堂兩側一般設有吏、戶、禮、兵、刑、工六房，政務較為冗雜的縣還從中分出糧科、馬科等。

縣衙中的承發房、架閣庫也設有吏。此外縣中的儒學、巡檢司、稅課局、遞運所、水馬驛、河泊所、倉庫、閘壩等機構均設有吏。

在縣級機構中設定的吏的名目有司吏、典吏、承發、驛吏、攢典等。看似吏員的數量遠遠多於官員，但是實際上對於很多縣衙來說，吏員的數量是遠遠不夠的，這是因為朝廷在之前有過明確的旨意：正統元年奏準，天下裁減衙門，每房止存司吏一名，典吏二名。

而實際上，最大的縣也不會有超過30名經制吏。分攤到全國一千多個縣，則每縣平均設吏十餘名，與制度規定大致相符。但是偌大一個縣，僅僅依靠數名官員的十數名最多不過三十名的經制吏員，顯然是無法管理的，所以地方衙門大量招募所謂的書算手，來協助官府處理政務，而這些被僱傭而來的書算往往魚龍混雜。

左都御史海瑞是有著豐富的地方州縣經驗的，他就痛陳書算之弊道：“所在守土等官輒便奏開生員、吏典人等納糧草、納銀兩等項事例，遂為長策一切小民，不分能書與不能書，不分市民與農民，一概聽缺充吏，不惟官司不得伊書辦文案，且有違舊例。更其三考役滿，又免考驗，一概照依資格出身，所以多不稱職。”

”。歷來源弊知深，猾宿書老惟，明難為最，事之糧錢率大“：稱中疏奏的坖載朱給在他，會有深此對也行時申士學大閣東。憚忌無更弊作，糧錢甲里、圖都計會，籍冊制編責負手書的間里鄉

。手算書些這代取員吏制經的廷朝用，題問個這決解要就次這坖載朱，了狂病心喪，憚忌無肆的加更就來事起做以所，中之系僚的明大在不就本們他為因，員空架，政縣持把，道一們員吏和往往手算書些這

。模規的門衙方地制控，冊造記登要也手算書於對，行才後之意同部吏呈上司使政布請報要須必，算書募招方地，手算書募招意隨方地制限格嚴，高提對相質素的員吏，選考行實也竟畢員吏於對廷朝在現為因，量數的算書減的能可儘，制編員吏的縣州加增，量數的員吏和員的縣州定確，況雜繁的務事和口人、稅賦的方地在所據，門衙關相方地及部吏同會廷朝令命坖載朱

。事此量商細詳要也們臣重部閣與坖載朱。件的頓整查清點重個一是也司二按布、道府方地，外之民親縣州了除