朱載坖當然也知道輔臣的意思，不過朱載坖有自己的看法，一來此案和郭桓案還是有很大的不同的，郭桓案多少有些借題發揮的意思，但是這次的盜銀案可是實打實的案子，二十八萬兩的白銀不翼而飛，可不是什麼小事情，朱載坖認為懲處此案的相關人員並沒有什麼不妥。
其次就是懲處的物件不同，郭桓案主要針對的是當時朝廷裡的官員們，但是這次朱載坖窮究盜銀案，主要是針對的六部的吏員，雖然朱載坖已經實行考選吏員幾年了，但是在京師和地方的吏員們，仍然有大量的世襲吏員存在，尤其是京師六部中，這些吏員往往比之朝廷的官員們貪墨起來更加瘋狂。
而且各種的陋規，也是這些吏員們最擅長搞得事情，朱載坖早就有打算收拾他們了，只是沒有足夠的證據罷了，而這次的盜銀案顯然給了朱載坖機會，朱載坖要藉機將這些六部的世襲小吏狠狠地收拾一頓，將這些人清理出六部，還有與之勾連的中下級官員，都是朱載坖收拾的物件。
不僅僅要將這一班碩鼠揪出來，更要追贓，二十八萬的官銀是絕對不能少的，同時更要將這些搞陋規的世襲小吏清理出朝廷，震懾他們，使他們不敢再貪贓枉法了，對於這些小吏的貪墨，朱載坖是深惡痛絕的，從某種意義上來說，他們比之一些部堂督撫的貪墨，更加令人憤怒，而且他們的膽大妄為，也是令人咋舌的。
朱載坖想要整頓六部的這些小吏，倒是得到了李春芳、張居正的贊同，從朱載坖即位以來，整頓官場風氣，實行三途並進，官場的怠惰之風已經有了很大的改善，但是吏員，尤其是六部的吏員，卻沒有多大的改變，因為這些吏員往往是世襲的，雖然不是官員，但是他們熟悉衙門中的各種文書，通曉衙門的明暗規則，對於很多官員們來說，沒有這些吏員，就很難開展工作，所以即便是朝廷推行吏員考選，六部的吏員仍然很頑固。
這其中又尤其是戶部最為明顯，因為這些戶部的積年老吏，把持賬目，甚至還有官員們的把柄，使得官員們不敢輕易開革他們，朱載坖這次終於逮到機會了，不把他們從六部掃地出門，才是怪事。
朱載坖直接對太子朱翊釴說道：“太祖論馭下之法，太子可記得？”
這是老朱家的家訓，朱翊釴當然記得，朱翊釴當即將太祖的祖訓背了出來：“天下治亂在於君臣能馭不能馭耳，若君能馭臣以禮法，臣能馭吏以體上， 故治由此始。若君不能馭臣，臣無以馭吏，則亂亦由此始。或雲胥吏小人，何預治亂？是大不然，吏詐則蠹政，民何由安。朕所以著為令者，正欲使上官馭吏， 動必以禮而嚴之於法。若吏卒背理違法，繩以死無論。此令行久矣，奈何貪官動 為下人所持，任其縱橫，莫敢誰何，所以政無所施，而民受枉。朕常謂若為官臨 政無馭吏之威，則諸事無成，馭得其法，則威立令行，事無不舉。”
朱載坖問道：“太子知道該怎麼辦了嗎？”
朱載坖的意思很清楚，這次朱翊釴要站在前臺上，對這些小吏重刑嚴懲，以太祖當年收拾這幫小吏的辦法嚴懲這些人。
當然在收拾這班小吏之前，朱載坖先要收拾的是錦衣親軍裡的敗類。
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