先後兩次會審，三法司很快就給出了意見，三法司都認為遼東問題上熊廷弼和王化貞全都有責任。

其中責任的大小熊廷弼比王化貞還重些，畢竟他是遼東經略是主帥，王化貞只是遼東巡撫，是熊廷弼名義上的下屬，這樣的慘敗你作為主帥再怎麼樣也是主要責任。

幾日後，三法司上奏，請求將熊廷弼、王化貞都判處死刑，特別提到熊廷弼判死刑存在是與之前的經略楊鎬、袁應泰比較的結果。

三法司的奏摺中寫道，熊廷弼比之楊鎬更多一逃，比之袁應泰反欠一死。事後又不聽從朝廷命令進行反攻，拖延戰機消極對戰罪加一等，若厚誅化貞，而廷弼少及於寬，不唯無以服天下萬世之心，恐無以服楊鎬、袁應泰之心矣……。

不過三法司雖然已有定論，但這個上奏天啟皇帝只是同意了三法司的結論，卻沒有馬上宣佈行刑。

這主要的原因有幾點。

第一是天啟皇帝雖然痛恨熊廷弼，當初起復熊廷弼的時候天啟皇帝是對他寄予厚望的，不僅親自召見了熊廷弼，和他單獨談了話，還在他離京的時候設宴相送，更從京營撥了5000軍隊給熊廷弼讓他指揮。

從這點來說，天啟皇帝對熊廷弼的厚待和期望可想而知，既然如此你作為臣子就應該報效皇恩，哪怕死在戰場上也是應該的。

可你熊廷弼又是怎麼做的呢？就因為和王化貞鬧矛盾，和小孩子一樣賭氣，至國家大事不顧，不僅輕易把山海關以東的地盤拱手讓給了後金建奴，後來天啟皇帝幾次三番催促熊廷弼給他將功補過機會，讓他儘快出兵奪回失地，你卻找各種理由推辭，死活不幹，面對這樣的情況，天啟皇帝心裡如何不惱？

當初有多重視和信任，現在就有多生氣和憤怒，別說是天啟皇帝了，哪怕是普通人也是這樣的反應。可就算這樣，天啟皇帝心裡還沒有直接處死熊廷弼的想法，下個旨讓人砍掉熊廷弼的腦袋很容易，可腦袋掉了再按回去卻是不可能的。

天啟皇帝知道熊廷弼雖有這樣那樣的毛病，性格也有缺陷，可不管怎麼說，熊廷弼依舊是大明難得的人才，尤其在遼東軍事上，大明能和熊廷弼相比的人目前根本沒有，再加上他在軍事上的卓越才能和眼光，就這麼直接殺掉未免有些可惜了。

既然三法司已有定論，決定判處熊廷弼死刑，天啟皇帝心中一口氣也就出了。馬上殺掉就沒這個必要了，先關起來再說，說不定日後可能還有用。

不僅天啟沒有馬上殺掉熊廷弼，就連之前薩爾滸之戰的罪魁禍首楊鎬也沒殺，這位已經被關了好幾年的罪人這一次藉著遼東戰事同樣也一起順手判了死刑，和熊廷弼一樣暫時沒執行，都關在牢裡養著呢。

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