回到廈門後，施琅立即投入緊張的工作之中。他日以繼夜地忙碌，幾乎忘記了休息，一方面著手整頓船隻，另一方面加強訓練士兵。他還親自監督武器和器械的製造，確保每一樣裝備都能達到最佳狀態。經過幾個月的努力，原本雜亂無章的水師變得船堅兵練，一切準備就緒。

施琅深知準備工作的重要性，因此在籌備過程中，他不僅關注戰船的修理和改進，還特別注重士兵的訓練。他親自指導士兵們進行戰術演練，提高他們的戰鬥技能和團隊協作能力。此外，他還精心挑選工匠和技術人員，確保武器和艦船的質量，力求在未來的戰鬥中發揮最大的效能。

在這一時期，施琅還積極蒐集情報，瞭解鄭氏集團的動態和防禦部署。他利用自己在臺灣的人脈網路，獲取了許多有價值的資訊，為即將到來的戰役制定了詳細的作戰計劃。

六。領軍攻臺

1683年（康熙二十二年）六月十四日，施琅率領清軍水師從銅山（今福建東山島）出發，開始了收復臺灣的征程。在策劃進攻路線時，施琅充分考慮了當時的風向。潮汐以及敵方的防禦情況。他決定乘著六月的西南季風，率領船隊穿越臺灣海峽，首先攻佔位於澎湖主島以南。鄭軍防守較為薄弱的八罩島。這樣做不僅可以獲得一個安全的錨泊地和進攻出發地，還可以佔據上風上流的優勢位置，以便更好地向澎湖發起攻擊。

六月十六日，施琅指揮的清軍艦隊首次向澎湖鄭軍發動進攻，但初戰並未取得預期成果。面對這一情況，施琅迅速調整策略，對下一步的作戰行動進行了周密的籌劃和部署。他將清軍分為四個部分：

主攻部隊：由施琅親自率領，擁有56艘大型戰船，負責正面進攻鄭軍的主要陣地娘媽宮。

東線攻擊部隊：由總兵陳蟒等人率領，共有50艘戰船，從澎湖港口東側突入雞籠嶼，作為奇兵配合主攻部隊夾擊娘媽宮。

西線攻擊部隊：由總兵董義等人統領，同樣擁有50艘戰船，從港口西側進入牛心灣，進行佯動登陸，以牽制鄭軍的西翼。

預備隊：其餘80艘戰船作為預備隊，跟隨主攻部隊隨時待命。

六月十八日，施琅派出戰船攻取澎湖港外的虎井。桶盤二島，掃清了外圍障礙。經過充分的休整和準備，六月二十二日早上七時，清軍向澎湖鄭軍發起了總攻。經過九個小時的激烈戰鬥，清軍取得了全面勝利，共擊斃和傷及鄭軍官兵約1.2萬人，俘虜了5000餘人，摧毀和繳獲鄭軍戰船190餘艘。鄭軍主將劉國軒則乘坐小船從北面的吼門逃往臺灣。

此次戰役中，清軍陣亡329人，受傷1800餘人。這場勝利不僅標誌著施琅多年以來的願望得以實現，也是中國歷史上一個重要的里程碑。隨著澎湖海戰的勝利，臺灣的防禦力量大大削弱，鄭克塽被迫發令，率領其臣下向清朝投降.1683年（康熙二十二年），臺灣正式納入清朝版圖。

七。招撫鄭氏

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