努爾哈赤去世後，代善的長子嶽託和三子薩哈璘向代善建議：“國不可一日無君，應當儘快確定新的領導者。四貝勒（皇太極）才德出眾，深受先帝的信任，大家都願意擁戴他，應該讓他儘快繼位。”在諸貝勒大臣會議上，代善首先提議擁戴皇太極，其他貝勒也紛紛表示贊同。因此，皇太極順利即位為汗，並與其他三大貝勒並坐。

代善在皇太極即位後重新活躍起來。當年十月，他掛帥出征蒙古扎魯特部，殺貝勒鄂爾寨圖，並生擒貝勒巴克等十四人。十一月四日，代善凱旋迴師，皇太極親自帶領諸貝勒大臣到鐵嶺樊河迎接。

天聰元年（1627年）五月，代善隨皇太極出征錦州。寧遠。當皇太極打算迎戰寧遠城外的明軍滿桂部隊時，代善與其他兩大貝勒極力反對，但皇太極為了洗刷父親在寧遠戰敗的恥辱，堅持作戰，結果後金軍損失慘重，被迫撤軍。

天聰三年（1629年）十月，皇太極決定西征明朝。當行至喀喇沁的青城時，代善與莽古爾泰以過於冒險為由反對攻明，但代善之子嶽託帶頭支援皇太極，最終代善和其他貝勒被迫服從。隨後，代善緊跟皇太極，一路進至北京城下，於德勝門外擊敗滿桂所率明軍，並在永定門外擊敗明軍，殺死明侍郎劉之綸。第二年二月，代善隨皇太極出塞返回瀋陽。

天聰五年（1631年）八月，代善參與了大淩河之戰，並取得勝利。在此期間，莽古爾泰在皇太極面前表現出不敬的態度，甚至露出刀刃。凱旋瀋陽後不久，莽古爾泰被褫奪和碩貝勒之位。同年，皇太極透過禮部參政李伯龍的奏請，解決了並坐的問題，代善順勢發言表示願意讓皇太極獨坐，自己和莽古爾泰侍坐於側。從那時起，皇太極在元旦朝賀時獨坐中央，代善則坐在右側的特殊位置，成為定製。

五。屢遭敲打

代善雖然表面上順從皇太極，但隨著皇太極逐漸鞏固自己的權力，兄弟之間的關係變得緊張。天聰九年（1635年）七月，察哈爾部林丹汗的遺孀歸順後金，皇太極安排代善娶林丹汗的大福晉娜木鐘。代善拒絕了這個安排，表示娜木鐘雖然地位尊貴但沒有足夠的財富，他希望娶另一位大福晉蘇泰太后。然而，蘇泰太后已經被許配給了剛喪偶的濟爾哈朗，皇太極多次派人勸說代善娶娜木鐘，但代善最終沒有接受。娜木鐘最終成為皇太極的妃子（懿靖大貴妃）。

同年九月，皇太極將林丹汗的另一位遺孀伯奇福晉賜給了豪格。豪格的妻子是皇太極姐姐莽古濟的女兒，這讓莽古濟感到不滿。當莽古濟經過代善營地時，代善邀請她入內，並設宴款待，贈送財物，並派馬送她回去。這件事被皇太極知曉後引發了極大的憤怒。

二十五日，皇太極召集諸貝勒大臣會議，公開指責代善輕視君主，並列舉了一系列代善的罪狀：在征伐明朝時違背眾貝勒意願欲中途撤軍，在徵察哈爾時也表現出類似的固執態度；賞罰不公，偏袒本旗；喜歡皇太極厭惡的人，討厭皇太極喜歡的人，這些都是在離間君臣關係。皇太極命諸貝勒。大臣審議代善的罪行，他們最終提出了四條罪狀，並建議處罰代善。皇太極只處罰了銀兩。馬匹和甲冑。這是代善第一次受到皇太極的敲打。

同年晚些時候，皇太極命令諸貝勒各自發誓修身，但他認為代善年事已高，只有幾年的壽命，不應該寫誓言。代善堅持要寫下誓言，最終寫下了一篇效忠皇太極的誓言。

天聰十年（1636年）四月五日，代善帶領眾貝勒大臣向皇太極勸進。四月十一日，皇太極正式稱帝，改元崇德，建國號大清。四月二十三日，皇太極冊封代善為和碩禮親王。同年十二月，代善隨皇太極出征朝鮮。

崇德二年（1637年）六月二十七日，從朝鮮凱旋後，皇太極命令追論徵朝鮮時諸王大臣違反軍紀的行為。法司給代善定了六條罪狀，並建議處罰。最終，皇太極赦免了代善及其他犯法的諸王。

同年七月五日，皇太極再次公開批評代善，指出自己對代善極為敬愛，但代善的行為多有錯謬。皇太極舉出了代善的一些過於卑微的行為，如無端鞭打自己的兒子瓦克達，徒步從泥濘中返回，親自牽馬和帶坐墊而不是攜帶侍從來見自己等，認為這是代善在表達對皇太極的不滿。皇太極告誡代善必須正身行義。優禮僚友。撫育降人。善治器械以輔助君主。這次事件是代善第二次受到皇太極的敲打。

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